信息技术的应用正在改变着现有的管理模式和管理方法。信息的公开化使得传统管理层的作用与地位受到很大影响：传统垂直管理中负责上传下达信息的中间层将由于信息的公开化而不再起作用；管理人员大量的统计、报表工作由计算机代替，要求其将主要精力放在信息的分析利用、再加工上；财会人员和财务部门由传统意义上的记账、核算向财务分析过渡等。信息技术的广泛应用对企业员工特别是管理人员提出了更高的要求。因此，拥有一批善于交流、善于利用信息资源的优秀管理人员，是计算机应用系统成功的保证，也是企业经营成功的保证。
严格的管理制度与良好的人员素质是企业信息化建设的必然要求。信息系统的应用增强了企业的决策能力和管理能力。但如果管理不善，涉及企业商业秘密的数据就有可能丢失。这将给企业造成无法估量的损失。另外，未经安全检测的媒介的使用也可能使整个信息系统陷入瘫痪状态，造成无法预知的后果。因此，信息系统必须建立严格的管理制度对管理权限进行明确界定。目前厦门卷烟厂ERP系统实行的就是岗位授权制，每个操作者都有自己相应的岗位权限并承担相应责任，都只能对自己的相关业务进行操作。网上审核任务列表的实施也是遵循这种机制，做到授权、控制、任务保持一致。
MIS系统的有效运转有赖于各部门管理人员的努力工作和相互配合。这就要求企业加强对管理人员相关信息技术的培训，着重让他们了解MIS系统对企业管理的影响、所具有的意义和潜在利益，以及MIS的处理流程、票据流转规范等。各类操作人员必须熟练掌握相应工作岗位的系统模块的应用，力求操作迅速和数据录入准确，以减少甚至杜绝工作中可能出现的差错。例如，企业ERP系统中的生产计划子系统，其中的卷包车间机台作业计划是指导物资供应部进行备料采购及高架库存管理的依据，也是卷包车间生产管理的准则；再如，技术中心的配方管理系统，其配方要求是企业质量控制、生产计划管理、车间管理、采购管理等环节的重要标准之一。而销售系统中各销区调拨情况的统计，能否快速、准确、全面反映企业产品的销售情况，对企业高层决策来说意义非同寻常。它将直接关系到企业整体生产任务的安排、方针目标的实现、企业利润空间的体现等。
